Juan Lunaa pidetään laajalti yhtenä kaikkien aikojen tärkeimmistä filippiiniläisistä taiteilijoista. Hän oli taidemaalari, kuvanveistäjä ja vallankumouksellinen. Lunan työ tunnetaan realismistaan, symbolismistaan ja allegoriastaan. Hän maalasi usein kohtauksia Filippiinien historiasta ja mytologiasta, ja hänen työnsä välittää usein kansallisen ylpeyden ja identiteetin tunnetta. Jotkut hänen tunnetuimmista teoksistaan ovat "Kleopatran kuolema" (1881), "España y Filipinas" (1884) ja "Pariisilainen elämä" (1892).
Lunan työllä on ollut syvä vaikutus Filippiinien taiteeseen ja kulttuuriin. Häntä pidetään yhtenä filippiiniläisen modernistisen liikkeen perustajista, ja hänen työnsä on vaikuttanut moniin myöhempiin filippiiniläisten taiteilijoiden sukupolviin. Lunan töitä ihaillaan ja arvostetaan myös ympäri maailmaa, ja sitä on säilytetty museoissa ja gallerioissa ympäri maailmaa.