Bach oli harras luterilainen, ja hänen uskonsa vaikutti hänen musiikkiinsa. Monet hänen teoksistaan perustuvat Raamatun tarinoihin tai teksteihin, kuten Pyhän Matteuksen passioon, Pyhän Johanneksen passioon ja Jouluoratorioon.
Muut säveltäjät
Bach sai vaikutteita myös muilta säveltäjiltä, mukaan lukien hänen omat sukulaiset (erityisesti hänen setänsä Johann Christoph Bach ja hänen isänsä serkku Johann Jakob Bach). Hän opiskeli monien muiden säveltäjien musiikkia, mukaan lukien Palestrina, Tallis, Byrd, Frescobaldi, Buxtehude ja Vivaldi.
Luonnonmaailma
Bachia inspiroi myös luonnollinen maailma. Monet hänen teoksistaan sisältävät liikkeitä, jotka herättävät lintujen, eläinten ja muiden luonnonilmiöiden ääniä. Esimerkiksi hänen kantaattinsa nro 215 "Sinfonia" kuvaa myrskyä, kun taas "Air" hänen orkesterisarjansa nro 3 jäljittelee satakielen laulua.
Omat kokemukset
Myös Bachin henkilökohtaiset kokemukset vaikuttivat hänen musiikkiinsa. Esimerkiksi hänen ensimmäisen vaimonsa Maria Barbaran kuoleman uskotaan inspiroineen "krusifiksusta" hänen h-molli-messuistaan.
Halu luoda kauneutta
Ennen kaikkea Bachia inspiroi halu luoda kaunista musiikkia. Hän uskoi, että musiikki oli Jumalan lahja, ja hän oli päättänyt käyttää kykyjään luodakseen musiikkia, joka ylistäisi Jumalaa ja kohottaisi ihmishenkeä.