Kamen Rider Kuugan tarina alkaa Yusuke Godaista, hyvänsydämisestä ja välittävästä nuoresta miehestä, joka asuu Tokion kaupungissa. Eräänä päivänä Yusuke löytää oudon kiven nimeltä Amadam Stone, joka sitoutuu häneen ja muuttaa hänet Kamen Rider Kuugaksi. Uudella voimallaan Yusukesta tulee oikeuden puolustaja, joka taistelee gurongeja vastaan, muinaisia olentoja vastaan, jotka ovat palanneet maailmaan aiheuttamaan tuhoa.
Gurongit ovat voimakkaita ja älykkäitä olentoja, joilla jokaisella on ainutlaatuiset voimansa ja kykynsä. Ne ruokkivat ihmisen elämänvoimaa, ja niiden tavoitteena on tuhota ihmiskunta. Yusuken on käytettävä kaikki voimansa ja rohkeutensa kukistaakseen Gurongit ja suojellakseen maan ihmisiä.
Koko sarjan ajan Yusuke kohtaa myös henkilökohtaisia haasteita ja esteitä. Hänen on kohdattava uusi roolinsa Kamen Riderina ja opittava tasapainottamaan supersankarivastuunsa henkilökohtaiseen elämäänsä. Hänen täytyy myös käsitellä ystäviensä ja liittolaistensa menetyksiä, jotka gurongit usein tappavat. Näistä haasteista huolimatta Yusuke on edelleen päättänyt taistella oikeuden puolesta ja suojella viattomia.
Kamen Rider Kuuga on jännittävä ja toiminnantäyteinen sarja, joka yhdistää elementtejä tieteiskirjallisuudesta, fantasiasta ja supersankarifiktiosta. Siinä on jännittäviä taistelukohtauksia, mieleenpainuvia hahmoja ja syvä, mukaansatempaava tarina. Sarja on katsottava Kamen Riderin ja yleensä tokusatsun ystäville.