* taudin bakteeriteoria: Pasteurin tutkimus osoitti, että mikro-organismit, eivät "huono ilma" tai spontaani synnytys, aiheuttivat sairauksia. Tämä oli vallankumouksellinen käsite, joka muutti lääketieteen.
* Pastörointi: Hän kehitti nesteiden kuumennusprosessin haitallisten bakteerien tappamiseksi, joka tunnetaan nykyään pastöroimisena. Tätä käytetään nykyään laajalti elintarviketeollisuudessa.
* Rokotus: Pasteur kehitti ensimmäiset rokotteet raivotautia ja pernaruttoa vastaan. Hänen työnsä loi perustan nykyaikaisille rokotusstrategioille.
* Kermentointi: Hän tutki mikro-organismien roolia käymisessä, mikä johti edistysaskeliin panimo-, viininvalmistus- ja meijeriteollisuudessa.
Hänen pääpainonsa oli edellä mainituilla aloilla, mutta hänen työnsä kosketti myös muita aloja:
* Kemia: Pasteur valmistui kemistiksi ja teki merkittävää tutkimusta kristallografiassa ja stereokemiassa.
* Kansanterveys: Hänen työnsä vaikutti valtavasti kansanterveyteen kehittämällä rokotteita ja ymmärtämällä tautien leviämistä.
Kaiken kaikkiaan Louis Pasteur oli mikrobiologian ja immunologian edelläkävijä, jonka panokset vaikuttavat edelleen ymmärryksemme sairauksista ja terveydestä.