Elokuvat
* The Stalking Moon (1968) - Sam Varnerina
* The Grasshopper (1970) - Jack Harrisina
* Vuoren toinen puoli (1975) - Leona
* The Last Married Couple in America (1980) - Johnina
* Teksasin paras pieni huora (1982) - Sheriffi Ed Earl Doddina
* S.O.B. (1981) - johtajana
* The Big Red One (1980) - Kapteenina
* A Little Sex (1982) - kuten tohtori Howard "H.B." Baker
* Niilin helmi (1985) - Omarina
* Some Kind of Wonderful (1987) - kuten Keith
* Kolme miestä ja vauva (1987) - kuten Pietari
* Alaton ase:Poliisiryhmän tiedostoista! (1988) - päällikkönä
* The Naked Gun 2 1/2:The Smell of Fear (1991) - päällikkönä
* Joulupukki (1994) - kuin Neil
* The Santa Clause 2 (2002) - kuin Neil
* The Santa Clause 3:The Escape Clause (2006) - kuin Neil
Televisio
* Lääkärit (1969-1971) - Dr. Davidina
* Bob Newhart Show (1972-1978) - Bob Hartleyna
* saippua (1977-1981) - Bensonina
* Tyhjä Nest (1988-1995) - tri Harry Westonina
* Kultaiset tytöt (1985-1992) - tohtori Harry Westonina
* Kultainen palatsi (1992) - tohtori Harry Westonina
Tämä on vain osittainen luettelo, ja Mulligan esiintyi monissa muissa projekteissa uransa aikana.
Hänet tunnettiin komediallisesta ajoituksestaan ja kyvystään kuvata sekä vakavia että humoristisia hahmoja. Hän oli erittäin arvostettu näyttelijä, ja monet nauttivat hänen esityksistään edelleen.