Sarjan edetessä tytöt saavat salaperäisiä viestejä ja uhkauksia "A:lta", joka näyttää tietävän heidän jokaisen liikkeensä ja salaisuutensa. He alkavat epäillä kaikkia ympärillään, mukaan lukien heidän ystävänsä, perheenjäsenensä ja jopa toisiaan. Tyttöjen on työskenneltävä yhdessä paljastaakseen "A":n henkilöllisyyden ja lopettaakseen kidutuksensa, samalla kun he käsittelevät omia henkilökohtaisia asioitaan ja salaisuuksiaan.
"Pretty Little Liars" tutkii ystävyyden, pettämisen, salaisuuksien ja identiteetin teemoja, kun tytöt navigoivat tiensä läpi heitä ympäröivän draaman ja mysteerit. Sarjassa on myös erilaisia romanttisia suhteita, perhedynamiikkaa ja käänteitä, jotka pitävät yleisön arvaamassa loppuun asti.