Tärkeimmät roolit:
* Doogie Howser, M.D. (1989-1993): Hänen läpimurtoroolinsa teini-ikäisenä ihmelääkärinä.
* Kuinka tapasin äitisi (2005–2014): Hän näytteli hurmaavaa ja rakastettavaa Barney Stinsonia.
* Sarja ikäviä tapahtumia (2017–2019): Hän näytteli synkkää kreivi Olafia tässä synkässä komediasovituksessa.
* Se on synti (2021): Hän näytteli päähenkilöiden ystävää Henryä tässä kehutussa draamassa Lontoon AIDS-kriisistä.
* Yksittämätön (2022-tässä): Tällä hetkellä näyttelee Michael Lawsonia, äskettäin eronnutta miestä, joka navigoi deittailuelämässä New Yorkissa.
Toistuvat roolit:
* Starship Troopers (1997): Hän esiintyi sotilaana nimeltä Carl Jenkins.
* Simpsonit (2000): Vieraili laulavana tarjoilijana jaksossa "The Mansion Family".
* Amerikkalainen isä! (2009-tähden): Äänenä Steve Smithin hahmo.
* Alkuräjähdyksen teoria (2010–2019): Hänellä oli toistuva rooli Barney the Stinson -hahmona.
Vierasilmiöt:
* The Muppets (1976-1981): Esiintynyt useissa jaksoissa.
* Dr. Quinn, Medicine Woman (1993): Vieraili nuorena lääkärinä.
* The West Wing (2000-2006): Hän näytteli vierailijaroolia eräässä jaksossa.
* Kadonnut (2004-2010): Hänellä oli ikimuistoinen vierasesiintyminen salaperäisenä hahmona.
* Glee (2009–2015): Vieraili useissa jaksoissa hauskan Bryan Ryanin roolissa.
Tämä ei ole tyhjentävä luettelo, mutta se kattaa merkittävimmät televisio-ohjelmat, joissa Neil Patrick Harris on ollut mukana. Hän on tunnettu monipuolisuudestaan ja komediallisesta ajoituksestaan, ja hän on jatkanut eri rooleja useissa eri genreissä.