1. Historialliset epätarkkuudet: Jotkut kriitikot väittävät, että elokuva ottaa tiettyjä historiallisia vapauksia, jotka poikkeavat Rizalin elämän todellisista tapahtumista. Esimerkiksi elokuva kuvaa Rizalin ryhtyvän romanttiseen suhteeseen paikallisen naisen kanssa nimeltä Josephine Bracken, kun taas jotkut historioitsijat väittävät, ettei tämän suhteen tueksi ole konkreettisia todisteita.
2. Luonnehdinnan syvyyden puute: Kriitikot huomauttavat myös, että elokuva ei täysin tutki Rizalin hahmon syvyyttä ja monimutkaisuutta. Elokuva esittää hänet usein yksiulotteisena sankarina syventymättä hänen sisäisiin kamppailuihinsa, motivaatioihinsa ja kasvuinsa.
3. Rizalin ideologian liiallinen yksinkertaistaminen: Elokuva esittelee Rizalin ajatukset ja uskomukset hieman yksinkertaistetulla tavalla, pelkistämällä ne muutamaksi laajaksi viestiksi isänmaallisuudesta, koulutuksesta ja yhteiskunnallisista uudistuksista. Kriitikot väittävät, että tästä lähestymistavasta puuttuu vivahteita ja se ei kaappaa kaikkia Rizalin henkisiä panoksia.
4. Riittämätön huomio Rizalin kirjallisiin teoksiin: Kun otetaan huomioon Rizalin merkittävä kirjallinen tuotos, jotkut kriitikot katsovat, että elokuva ei anna tarpeeksi painoa tai analyysiä hänen kirjoituksistaan, kuten romaaneista "Noli Me Tangere" ja "El Filibusterismo". Näitä teoksia, joilla oli ratkaiseva rooli Filippiinien itsenäisyysliikkeessä, ei käsitellä elokuvassa perusteellisesti.
5. Kontekstualisoinnin puute: Elokuva keskittyy ensisijaisesti Rizalin henkilökohtaisiin kokemuksiin Dapitanissa tarjoamatta laajempaa kontekstia Filippiinien poliittisesta ja sosiaalisesta ilmapiiristä tuon ajanjakson aikana. Kriitikot väittävät, että historiallisen kontekstin syvempi tutkiminen olisi lisännyt Rizalin toiminnan merkitystä ja vaikutusta.
6. Rajoitetut elokuvatekniikat: Jotkut kriitikot pitävät "Rizal In Dapitanin" elokuvantekotekniikkaa inspiroimattomina ja luovuuden puutetta. He väittävät, että elokuva nojaa vahvasti perinteisiin tarinankerrontamenetelmiin eikä siinä hyödynnetä innovatiivisempia tai visuaalisesti kiinnostavampia elokuvallisia elementtejä.
Näistä kritiikistä huolimatta monet katsojat arvostavat elokuvaa sen dramatisoinnista Rizalin elämästä ja sen yrityksestä tuoda hänen tarinansa laajemmalle yleisölle. Edellä mainitut kohdat kuitenkin korostavat alueita, joilla elokuva olisi mahdollisesti voinut parantaa historiallista tarkkuuttaan, hahmojen kehitystä, temaattista tutkimista ja elokuvallista toteutusta.