Tässä syy:
* Ultimate Alliance 2 julkaistiin vuonna 2009. Deadpoolin suosio räjähti sen jälkeen, ja siitä tuli merkittävä toimija Marvel Cinematic Universumissa vuonna 2016.
* Pelin painopiste oli eri tarinassa. Ultimate Alliance 2 keskittyi sisällissodan tarinaan, ja se sisältää sankareita ja roistoja, jotka ovat linjassa Iron Manin ja Kapteeni Amerikan kanssa.
* Deadpoolin hahmo oli vähemmän näkyvä tuolloin. Vaikka hän oli suosittu antisankari, hän ei ollut niin laajalti tunnettu tai yhtä valtavirtaa kuin nykyään.
Joten vaikka on mahdollista, että Deadpoolin ottamista mukaan olisi voitu suunnitella, hän ei lopulta ollut mukana viimeisessä pelissä.