Cecilin toiminnan tarkat motiivit ovat historiallisen keskustelun kohteena. Joitakin mahdollisia selityksiä ovat kuitenkin:
* kruunun suojaaminen: Cecil oli monarkian vahva kannattaja ja näki ruutijuonen vakavana uhkana sekä kuningatar Elisabetille että kuningas Jamesille. Hän luultavasti koki velvollisuutensa paljastaa ja purkaa juoni kruunun turvallisuuden ja valtakunnan vakauden varmistamiseksi.
* Voimansa säilyttäminen: Pääministerinä Cecilillä oli huomattava valta ja vaikutusvalta. Juonen paljastaminen vahvistaisi hänen asemaansa osoittamalla pätevyyttään ja uskollisuuttaan kuninkaalle. Se auttaisi häntä myös eliminoimaan mahdolliset kilpailijat, jotka olisivat saaneet tukea juonetta.
* Poliittinen etu: Gunpowder Plot oli syvästi jakautunut tapahtuma, joka lisäsi uskonnollisia jännitteitä Englannissa. Cecil näki sen todennäköisesti mahdollisuutena vahvistaa omaa poliittista asemaansa esittämällä itsensä vakiintuneen järjestyksen suojelijana ja puolustajana katolista ääriliikettä vastaan.
* Henkilökohtainen usko: Cecil oli harras protestantti, ja hän piti juoni katolisena salaliittona protestanttista monarkiaa vastaan. Hänen vahva uskonnollinen vakaumuksensa on saattanut motivoida häntä aktiivisesti ajamaan ja paljastamaan juonittelijoita.
On tärkeää huomata, että nämä ovat vain mahdollisia selityksiä. Cecilin motivaatiot olivat todennäköisesti monimutkaisia ja johtuivat näiden tekijöiden yhdistelmästä.
Tarkoista syistä huolimatta Cecilin rooli ruutijuonen paljastamisessa oli kiistatta merkittävä. Hänen toimintansa johti juonittajien pidätykseen, parlamenttia vastaan tehdyn hyökkäyksen estämiseen ja protestanttisen vallan vahvistamiseen Englannissa.