Elokuvat:
* Pretty in Pink (1986) :Tämä teini-rom-com on kiistatta hänen tunnetuin roolinsa.
* Superman IV:The Quest for Peace (1987) :Hän näytteli Lenny Luthoria, Lex Luthorin poikaa.
* Kolme muskettisoturia (1993) :Komediallinen ote klassiseen tarinaan, jossa hän näytteli Planchetia.
* Hot Shots! (1991) ja Hot Shots! Osa Deux (1993) :Kaksi parodiaelokuvaa pääosissa Charlie Sheen, joissa Cryer näytteli sivuroolia.
* Dumb and Dumber (1994) :Pieni mutta mieleenpainuva rooli tarjoilijana.
* Juuri vierailulla (2001) :Ranskalais-amerikkalainen komedia, jossa Cryer esittää keskiaikaista ritaria.
* The Trouble with Men (2010) :Romanttinen komedia, jonka näyttelijät ovat täynnä tähtiä.
* Hit Man (2012) :Trilleri palkkamurhaajasta, jonka tehtävänä on tappaa Yhdysvaltain senaattori.
Televisio:
* Kuuluisa Teddy Z (1989-1990) :Hänen ensimmäinen pääroolinsa TV-sarjassa.
* The Trouble with Larry (1993-1994) :Lyhytaikainen sitcom, jossa Cryer näytteli nimihenkilöä.
* Kumppanit (2011–2012) :Hän näytteli yhdessä Michael Urien kanssa tässä sitcomissa kahden asianajajan kumppanuudesta.
* Kaksi ja puoli miestä (2003-2015) :Cryerin läpimurtorooli Alan Harperina, joka voitti hänelle neljä Primetime Emmy -palkintoa komediasarjan erinomaisesta sivuosasta.
* Äiti (2013–2021) :Hän liittyi tämän sitcomin näyttelijöihin kaudella 4 näytellen Adamin roolia, Christyn (näyttelijänä Anna Faris) rakkautta.
* Harlemin kummisetä (2019-tähden) :Cryer näyttelee pormestari Robert Wagneria, New Yorkin korruptoitunutta pormestaria rikospomo Bumpy Johnsonin aikakaudella.
Tämä on vain valikoima hänen merkittävimpiä projektejaan. Jon Cryer on ollut mukana lukuisissa muissa elokuva- ja televisioprojekteissa uransa aikana. Hän on monipuolinen ja lahjakas näyttelijä, joka on osoittanut kykenevänsä näyttelemään sekä komedia- että dramaattisia rooleja.