Aluksi Henrik oli harras katolinen ja jopa sai tittelin "Uskon puolustaja" paavi Leo X:ltä protestanttisen uskonpuhdistuksen vastaisista kirjoituksistaan. Hän oli perinteisten katolisten oppien ja käytäntöjen vankkumaton puolustaja ja vastusti henkilökohtaisesti harhaoppisia opetuksia. Hänen halunsa mitätöidä avioliittonsa Katariina Aragonilaisen kanssa ja mennä naimisiin Anne Boleynin kanssa johti kuitenkin konfliktiin paavin kanssa, joka kieltäytyi mitätöimisestä.
Henry ei saanut Roomalta toivottua mitätöintiä, vaan otti asiat omiin käsiinsä. Vuonna 1534 hän hyväksyi Act of Supremacy, joka julisti hänet Englannin kirkon ylimmäksi pääksi ja antoi hänelle valtuudet uudistaa Englannin kirkko. Tämä merkitsi virallista eroa roomalaiskatolisen kirkon kanssa, ja Englannista tuli protestanttinen kansakunta.
Kuningas Henrik osallistui aktiivisesti Englannin kirkon opin ja liturgian muotoiluun. Hän hyväksyi "Kymmenen artikkelin" julkaisemisen vuonna 1536 ja myöhemmin "Kuuden artikkelin" vuonna 1539, jotka määrittelivät Englannin kirkon teologiset ja liturgiset käytännöt. Vaikka Englannin kirkko säilytti edelleen monia katolisia perinteitä ja rituaaleja, se omaksui tietyt protestanttiset periaatteet, kuten englanninkielisen Raamatun lukemisen ja uskon vanhurskauttamisen korostamisen.
Henrikin hallituskaudella Englannissa tapahtui merkittäviä uskonnollisia muutoksia. Luostarit ja uskonnolliset talot hajotettiin, ja kruunu takavarikoi heidän maansa ja omaisuutensa. Henryn uskonnollisen politiikan kriitikot ja vastustajat kohtasivat vainoa, mukaan lukien Thomas More ja John Fisher, jotka teloitettiin, koska he kieltäytyivät tunnustamasta kuninkaan ylivaltaa kirkkoon nähden.
Lisäksi Henryn uskonnollisella politiikalla oli syvällinen vaikutus poliittisiin, taloudellisiin ja sosiaalisiin rakenteisiin Englannissa. Esimerkiksi luostarien hajottaminen johti maiden ja varallisuuden uudelleenjakoon, mikä muutti eri yhteiskuntaryhmien välistä valtadynamiikkaa.
Kuningas Henrik VIII koki elämänsä aikana useita muutoksia uskonnollisissa vakaumuksissaan ja käytännöissään. Vaikka hän ei koskaan täysin omaksunut radikaalimpia protestanttisia oppeja, hän siirsi Englannin kirkon pois katolilaisuudesta kohti maltillisempaa protestanttista kantaa. Hänen toimintansa loi lopulta perustan anglikaaniselle kirkolle, joka on edelleen virallinen kirkko Englannissa tänään.