Mikä on Jacobsen-indeksi?

Fylogeneettisen puun Jacobsenin indeksi mittaa sen oksaisuutta tai sitä, missä määrin puu sisältää lyhyitä sisäoksia. Se määritellään puun kokonaispituuden (kaikkien puussa olevien oksien pituuksien summa) suhteeksi pienimpään mahdolliseen puun pituuteen, joka on puun pituus, jossa on sama määrä taksoneja ja ilman sisäisiä oksia ( kaikki taksonit ovat yhteydessä suoraan juureen).

Korkea Jacobsen-indeksi osoittaa puuta, jossa on monia lyhyitä sisäoksia, mikä voi olla seurausta taksonien nopeasta säteilystä tai nopeasta luonteenkehityksen nopeudesta. Matala Jacobsen-indeksi osoittaa puuta, jossa on vähän lyhyitä sisäoksia, mikä voi johtua taksonien hitaasta säteilystä tai alhaisesta luonteenkehityksen nopeudesta.

Jacobsen-indeksiä käytetään usein vertaamaan eri fylogeneettisten puiden suhteellista haaraisuutta, ja sen avulla voidaan arvioida erilaisten evoluutiomallien sopivuutta tiettyyn aineistoon.