Alfred Wegener (1. marraskuuta 1880 – marraskuun alku 1930) oli saksalainen meteorologi ja geofyysikko, joka tunnetaan parhaiten mantereiden kulkeutumisteoriastaan.
Wegenerin kuuluisin teos on Mannerten ja valtamerten synty (1912), jossa hän ehdotti, että maanosat oli kerran liitetty yhteen maa-alueeksi, jota hän kutsui Pangeaksi. Hän väitti, että Pangea oli alkanut hajota noin 200 miljoonaa vuotta sitten ja että maanosat olivat sittemmin ajautuneet erilleen.
Monet tiedemiehet suhtautuivat Wegenerin teoriaan aluksi skeptisesti, mutta sittemmin se on hyväksytty laajalti. Mannerten ajautumista pidetään nykyään yhtenä geologian avainkäsitteistä.
Manner-ajotyönsä lisäksi Wegener antoi merkittävän panoksen meteorologian ja geofysiikan aloille. Hän oli yksi ensimmäisistä tiedemiehistä, jotka tutkivat yläilmakehää, ja hän kehitti useita tärkeitä teorioita säästä ja ilmastosta.
Wegener kuoli vuonna 1930 retkillä Grönlantiin. Hän oli 50-vuotias.