Séguy syntyi Toulonissa Ranskassa 1. heinäkuuta 1877. Hän osoitti intohimoa luonnonhistoriaan jo nuorena ja aloitti hyönteisten keräämisen 12-vuotiaana. Hän opiskeli lääketiedettä Montpellierin yliopistossa ja valmistui vuonna 1902.
Séguy aloitti uransa sotilaslääkärinä, mutta pian hän omistautui entomologialle. Hän työskenteli Muséum national d'histoire naturellessa Pariisissa vuodesta 1906 eläkkeelle siirtymiseensä vuonna 1942. Museoaikanaan hän kuratoi kaksihaarakokoelmaa ja julkaisi aiheesta lukuisia tieteellisiä artikkeleita ja kirjoja.
Séguyn päätutkimusalue oli Muscidae-suku, ja hänestä tuli tämän ryhmän maailmanlaajuinen asiantuntija. Hän kuvasi yli 1000 uutta Muscidae-lajia ja julkaisi useita monografioita ja luetteloita suvusta. Hän työskenteli myös muiden Diptera-heimojen, mukaan lukien Tephritidae, Conopidae ja Cecidomyiidae, parissa.
Tieteellisen työnsä lisäksi Séguy oli myös aktiivinen jäsen useissa tieteellisissä yhdistyksissä, mukaan lukien Société entomologique de France ja Lontoon Royal Entomological Society. Hänelle myönnettiin Lontoon Linnean Societyn Linnean-mitali vuonna 1939 ja Pariisin tiedeakatemian Prix Constant vuonna 1949.
Séguy kuoli Pariisissa 23. lokakuuta 1951 74-vuotiaana. Hän oli tuottelias entomologi, joka osallistui merkittävästi Diptera-tutkimukseen, ja tutkijat mainitsevat hänen työnsä edelleen laajalti.