- "Miksi risti?" (1901) :
Tämä on hänen tunnetuin teoksensa, joka esittää teologiset perusteet Jeesuksen Kristuksen ristiinnaulitsemiselle ja miten se merkitsee Jumalan rakkautta ja armoa.
- "Sielun taistelukenttä:Tutkimus pyhityksen tieteestä" (1903) :
Tämä kirja tutkii kristityn hengellistä matkaa ja sitä, kuinka uskovien tulisi pyrkiä henkilökohtaiseen pyhyyteen ja voittoon sisäisissä kamppailuissaan.
- "Onnen päivän salaisuus" (1904) :
Tämän kirjan tarkoituksena on innostaa ihmisiä löytämään onnea ja tyytyväisyyttä lähestymällä Jumalaa ja omaksumalla hengellisen muutoksen elämän.
- "Elämä, joka voittaa" (1906) :
Tämä teos korostaa elintärkeän ja voittoisan kristillisen elämän tärkeyttä ja korostaa vahvan uskon ja johdonmukaisen antautumisen tarvetta Jumalan tahdolle.
- "Valtakunnan avain" (1907) :
Tässä kirjassa Johnstone selittää Jeesuksen Kristuksen opetuksia ja korostaa henkilökohtaisen opetuslapseuden ja Jumalan käskyjen mukaisen elämän merkitystä.
- "Varma pelastuksen tie" (1909) :
Tämä teos tarjoaa suoraviivaisen ja ytimekkäästi selityksen siitä, kuinka ihmiset voivat saada pelastuksen uskomalla Jeesukseen Kristukseen.
- "Jumalan suuruus" (1919) :
Tämä kirja tutkii Jumalan majesteettisuutta ja suvereniteettia keskittyen Hänen ominaisuuksiinsa ja siihen, kuinka ne vaikuttavat ihmisten ymmärrykseen ja palvontaan.
- "Risti ja sen merkitys" (1930) :
Johnstone tarkastelee uudelleen Kristuksen ristiinnaulitsemisen merkitystä ja selvittää sen monitahoisia vaikutuksia ihmisen pelastukseen ja sovintoon Jumalan kanssa.
Nämä ovat joitakin John Chalmers Johnstonen merkittävistä kirjoituksista, jotka osoittavat hänen teologisen syvyytensä ja hengellisen vaikutuksensa, joka hänellä oli lukuisiin lukijoihin vuosien varrella.