- Sinfoniat :Haydn sävelsi yli 100 sinfoniaa, ja monia niistä pidetään klassisen aikakauden mestariteoksina. Jotkut hänen tunnetuimmista sinfonioistaan ovat:
- Sinfonia nro 45, "Farewell"
- Sinfonia nro 60, "Il distratto"
- Sinfonia nro 88, "Letter V"
- Sinfonia nro 92, "Oxford"
- Sinfonia nro 94, "Yllätys"
- Sinfonia nro 101, "Kello"
- Sinfonia nro 103, "Rummunpoimutus"
- Sinfonia nro 104, "Lontoo"
- Jousikvartetot :Haydn sävelsi myös yli 80 jousikvartettoa, joita pidetään yhtenä genren hienoimmista esimerkeistä. Jotkut hänen tunnetuimmista jousikvartetoistaan ovat:
- Jousikvartetto G-duuri op. 76, nro 1
- Jousikvartetto C-duuri op. 76, nro 3 ("Keisari")
- Jousikvartetto f-molli op. 20, nro 5
- Jousikvartetto g-molli op. 74, nro 3 ("The Rider")
- Jousikvartetto d-molli op. 76, nro 2 ("Quinten")
- Jousikvartetto B-duuri op. 76, nro 4 ("Auringonnousu")
- Pianosonaatit :Haydn sävelsi yli 50 pianosonaattia, joille on ominaista eleganssi ja nokkeluus. Jotkut hänen tunnetuimmista pianosonaateistaan ovat:
- Pianosonaatti C-duuri, Hob. XVI:50
- Pianosonaatti D-duuri, Hob. XVI:24
- Pianosonaatti E-duuri, Hob. XVI:49
- Pianosonaatti F-duuri, Hob. XVI:23
- Pianosonaatti G-duuri, Hob. XVI:40
- Konsertit :Haydn sävelsi useita konserttoja eri instrumenteille, mukaan lukien viulukonsertot, sellokonsertot ja pianokonsertot. Jotkut hänen tunnetuimmista konsertoistaan ovat:
- Viulukonsertto G-duuri, Hob. VIIa:4
- Sellokonsertto C-duuri, Hob. VIIb:1
- Pianokonsertto D-duuri, Hob. XVIII:11
- Pianokonsertto B-duuri, Hob. XVIII:13
- Oratoriot :Haydn sävelsi myös useita oratorioita, jotka ovat suurimuotoisia uskonnollisia tekstejä sisältäviä kuoroteoksia. Jotkut hänen tunnetuimmista oratorioistaan ovat:
- Luominen
- Vuodenajat
- Il Ritorno di Tobia