* Piano: Hän on maininnut pianonsoiton haastatteluissa ja jopa esiintynyt sillä joissakin rooleissaan.
* Kitara: Hänet on nähty soittamassa kitaraa joissakin televisioesiintymisissään, ja hän on jopa esiintynyt bändin kanssa.
* Rummut: Hän on näyttänyt rummunsoittotaitojaan muutamassa esiintymisessä.
* Ukulele: Hänellä on kotonaan ukulele ja hän on osoittanut kiinnostusta sen oppimiseen.
Vaikka Neil Patrick Harris ei ole ammattimuusikko, hän näyttää nauttivan eri instrumenttien soittamisesta huvin vuoksi ja on jopa sisällyttänyt ne työhönsä.