Katy Perry käyttää koko kappaleen ajan metaforista kieltä ja kuvia välittääkseen tunteidensa syvyyden. Hän kutsuu itseään "keskyön haamuksi" ja vertaa muistojaan "muinaisiin kirjoihin". Nämä kirjalliset välineet viittaavat kummittelevaan, ahdistavaan nostalgiaan, joka viipyy laulajan mielessä.
Kappaleen kertosäe korostaa näiden ajatusten toistuvaa luonnetta, kun Perry toistaa lausetta:"En tiedä miksi ajattelen sinua jatkuvasti." Tämä toisto korostaa henkilön jatkuvaa ja kutsumatonta läsnäoloa hänen ajatuksissaan.
Laulun edetessä Perry kuvailee, kuinka henkilön poissaolo on jättänyt hänen elämäänsä huomattavan tyhjyyden. Hän laulaa "Toivon, että minulla olisi jotain, josta voisit pitää kiinni", välittäen tunteen kaipauksesta fyysistä yhteyttä, joka ei ole enää mahdollista.
Sanoituksella, kuten "Älä halua sinua tänne ilman minua", Perry paljastaa emotionaalisen konfliktinsa ja menneisyyden muistamisen katkeransuloisen luonteen. Samalla kun hän muistelee heidän jakamiaan rakastettuja hetkiä, hän ilmaisee pelkonsa, että henkilö saattaa palata ja häiritä hänen sittemmin rakentamaansa emotionaalista vakautta.
Kappaleen silta sisältää rivit:"Katson tähtiä yllä tietäen, että katsot taaksepäin jostain uudesta." Nämä sanoitukset viittaavat siihen, että erosta huolimatta niiden välillä on kosmisen yhteyden tunne. Ajatus rinnakkaisesta olemassaolosta ja ajatus samojen tähtien katsomisesta luovat runollisen kuvauksen kahden yksilön välisestä kestävästä siteestä.
Kaiken kaikkiaan Katy Perryn "Thinking of You" on koskettava tutkimus rakkauden, kaipauksen ja aiempien suhteiden vaikutuksesta tunne-elämäämme monimutkaisista syistä. Elävien kuvien ja metaforisen kielen avulla laulu vangitsee katkeransuloisen kokemuksen muistella rakastettua henkilöä ja tunnustaa, että on mentävä eteenpäin.