Debussyn kuuluisin teos on luultavasti orkesterisarja "La Mer" (1905). Muita tunnettuja teoksia ovat pianokappaleet "Clair de lune" sarjasta "Suite bergamasque" (1890), "Prélude à l'après-midi d'un faune" (1894) ja ooppera "Pelléas et Mélisande" ( 1902).
Debussyn musiikilla oli syvällinen vaikutus musiikin historiaan. Hänen työnsä auttoi luomaan musiikkiin uutta estetiikkaa, joka perustui subjektiivisempaan ja tunneperäisempään reaktioon maailmaan. Hän auttoi myös murtamaan perinteisiä esteitä klassisen musiikin ja populaarimusiikin välillä. Debussyn vaikutus näkyy monien myöhempien säveltäjien, mukaan lukien Maurice Ravelin, Igor Stravinskyn ja Bela Bartokin, musiikissa.