* Kryptoniitti: Tämä radioaktiivinen mineraali Supermanin kotiplaneetalta Kryptonista on hänen tunnetuin heikkoutensa. Kryptoniitille altistuminen heikentää Supermania, mikä tekee hänestä sairaan ja alttiita vammoille. Eri tyyppisillä kryptoniiteilla on erilaisia vaikutuksia, joista jotkut ovat tappavampia kuin toiset.
* Magic: Vaikka Superman on uskomattoman vahva, hän on osoittanut haavoittuvuutta taikuudelle. Hahmot, joilla on maagisia kykyjä, ovat voineet satuttaa Supermania, vaikka tämä olisi muuten voittamaton.
* Punaisen auringon säteily: Supermanin voimia ruokkii Maan keltainen aurinko. Altistuminen punaiselle auringon säteilylle, kuten hänen kotiplaneettansa Krypton, heikentää häntä ja lopulta tyhjentää hänen voimansa kokonaan.
* Tietyt psykologisiin hyökkäykset: Vaikka Superman on uskomattoman sitkeä, hän voi olla alttiina psyykkisille hyökkäyksille. Jotkut roistot ovat pystyneet hyödyntämään hänen inhimillisiä tunteitaan ja moraalitajuaan, mikä saa hänet kyseenalaistamaan tekojaan ja heikentämään häntä hetkellisesti.
On tärkeää muistaa, että Supermanin haavoittuvuuksia on tutkittu ja kuvattu eri tavalla vuosien varrella, riippuen kirjoittajasta ja kerrottavasta tarinasta.