Albus ja Scorpius löytävät salaperäisen ajankääntäjän ja käyttävät sitä matkustaakseen ajassa taaksepäin, muuttaen vahingossa menneisyyttä ja luoden vaihtoehtoisen aikajanan, jossa Voldemortia ei ole voitettu ja paha on jäljellä. Albus ja Scorpius joutuvat kilpailemaan aikaa vastaan palauttaakseen alkuperäisen aikajanan ja korjatakseen asiat samalla kun kamppailevat omien henkilökohtaisten kamppailujensa ja perheidensä perinnön kanssa.
Koko matkan ajan Albus ja Scorpius lähtevät erilaisiin aikamatkustavallisiin seikkailuihin, kohtaavat alkuperäisen Potter-sarjan tuttuja hahmoja ja paljastavat syviä salaisuuksia ja paljastuksia menneisyydestään ja identiteetistään. Kun he pyrkivät korjaamaan aiheuttamansa vahingot, he oppivat ystävyyden, rohkeuden ja menneisyyden kohtaamisen todellisen merkityksen paremman tulevaisuuden muovaamiseksi.