Tässä syy:
* Virheet ja häiriöt: Peli oli täynnä bugeja, virheitä ja kaatumisia, mikä teki siitä toisinaan lähes pelikelvottoman.
* Huono tasoinen suunnittelu: Monet tasot tuntuivat inspiroimattomilta ja toistuvilta turhauttavista kamerakulmista ja hankalia asetteluista.
* Kätevät säätimet: Sonicin liike tuntui jäykältä ja reagoimattomalta, minkä vuoksi häntä oli vaikea hallita.
* Inspiroimaton tarina: Tarina oli mutkikas ja huonosti kirjoitettu, ja se sisälsi närästyksen arvoista dialogia ja heikkoa juoni.
* Huono suorituskyky: Peli sujui huonosti kaikilla alustoilla, kehysnopeus laski ja pätkii.
Vaikka joillakin faneilla saattaa olla henkilökohtaisia mieltymyksiä, Sonic the Hedgehog (2006) on yleisesti tunnustettu lukuisista puutteistaan ja on erinomainen esimerkki siitä, kuinka peli voi epäonnistua useilla tasoilla.
On syytä huomata, että muut pelit, kuten Sonic Boom:Rise of Lyric ja Sonic the Hedgehog (2017) sai myös paljon kritiikkiä ja niitä pidetään usein huonoimpien joukossa.