Näin se toimii:
1. Pomo-kaksintaistelu :Taistelet "Viimellistä pomoa" vastaan Viimeisessä tarinassa tasolla.
2. Muunnosta :Voitettuaan pomon Sonic muuttuu "super"-muotoonsa.
3. Viimeinen taistelu :"Lopullinen pomo" ilmestyy uudelleen uudessa muodossa, ja taistelet sitä vastaan uudelleen samalla tasolla .
Joten et etene eri tasolle ensimmäisen pomotaistelun jälkeen. Jatkat yksinkertaisesti taistelua "Final Bossia" vastaan sen uudessa, tehokkaammassa muodossaan Sonicin muuttumisen jälkeen.