Vuoden 1921 alussa Kronstadtin kaupungin merimiehet ja työläiset kapinoivat bolshevikkihallintoa vastaan. He vaativat suurempaa demokratiaa, vapautta ja taloudellisia uudistuksia. Trotski lähetettiin tukahduttamaan kapina, ja hän teki sen raa'alla voimalla. Tuhansia kapinallisia tapettiin ja kapina murskattiin.
Vasemmistoopposition puhdistus
1920-luvun lopulla Trotski ja hänen kannattajansa muodostivat vasemmistoopposition, bolshevikkipuolueen ryhmän, joka vastusti Josif Stalinin politiikkaa. Stalin vastasi puhdistamalla vasemmistoopposition puolueesta, ja monet sen jäsenistä pidätettiin, karkotettiin tai teloitettiin. Trotski itse karkotettiin Neuvostoliitosta vuonna 1929.
Sergei Kirovin salamurha
Vuonna 1934 Sergei Kirov, tunnettu bolshevikkijohtaja ja Stalinin läheinen liittolainen, murhattiin. Stalin syytti salamurhasta Trotskia ja käytti sitä tekosyynä käynnistääkseen suuren puhdistuksen, sortoaallon, jonka seurauksena miljoonia ihmisiä pidätettiin, vangittiin tai teloitettiin.
Väitetty yhteistyö natsi-Saksan kanssa
Toisen maailmansodan aikana Trotski asui maanpaossa Meksikossa. Stalin syytti häntä yhteistyöstä natsi-Saksan kanssa, ja lopulta Neuvostoliiton agentti murhasi hänet vuonna 1940. Ei ole todisteita väitteelle, että Trotski teki yhteistyötä natsien kanssa, ja yleisesti uskotaan, että Stalin oli tappanut hänet, koska hän pelkäsi. hänen vaikutuksensa ja suosionsa.