Shakespearen kirjoittamista on kuitenkin vuosisatojen ajan ollut useita teorioita ja kiistoja. Joitakin suosituimpia vaihtoehtoisia teorioita ovat:
* Oxfordin Earl: Earl: Tämä teoria viittaa siihen, että Oxfordin 17. Earl Edward de Vere oli Shakespearen teosten todellinen kirjoittaja.
* Baconian teoria: Tunnettu filosofi ja valtiomies Francis Bacon ehdottaa tämän teorian todellisena kirjailijana.
* Marlowe -teoria: Tämä teoria hyvittää Christopher Marlowen, toisen näytelmäkirjailijan, Shakespearen teosten todellisena kirjoittajana.
Vaikka näillä vaihtoehtoisilla teorioilla on omat argumentinsa, konkreettisten todisteiden puute ja epäsuoran todisteen ylivoimainen joukko, joka viittaa William Shakespeareen, koska kirjoittaja on johtanut suurimman osan tutkijoista ja kriitikkoista uskoa olevansa todellinen kirjailija.
On tärkeää muistaa, että Shakespearen näytelmien kirjoittaminen on edelleen jatkuvan keskustelun ja keskustelun aihe.