Yksi teoria on, että venäläiset itse keksivät balalaikan. Tämä perustuu siihen, että balalaika on perinteinen venäläinen soitin, ja sen olemassaolosta Venäjällä on todisteita jo 1600-luvulla.
Toinen teoria on, että balalaikan keksi ryhmä venäläisiä muusikoita, jotka tunnetaan nimellä guslarit. Guslarit olivat kiertäviä muusikoita, jotka soittivat erilaisia kielisoittimia, mukaan lukien balalaikaa. Heidän uskotaan levittäneen tietoa balalaikasta koko Venäjälle.
Lopuksi jotkut ihmiset uskovat, että balalaikan on saattanut keksiä Vasili Andrejev. Andrejev oli venäläinen muusikko ja säveltäjä, joka eli 1800-luvun lopulla ja 1900-luvun alussa. Hänelle on tunnustus balalaikan popularisoinnista ja sen tuomisesta maailman tietoisuuteen.
Lopulta balalaikan todellista keksijää ei ehkä koskaan tiedetä. Soittimella on kuitenkin pitkä ja rikas historia, ja sitä soittavat edelleen muusikot ympäri maailmaa.