Voimme kuitenkin tunnistaa joitain alueita, joilla Finney kohtasi vastustusta ja kritiikkiä:
* Hänen painottaman "uusien toimenpiteiden" herättämisen: Jotkut perinteisistä papistoista pitivät Finneyn menetelmiä, kuten "levottomien penkkien" ja "pitkittyneiden kokousten" käyttöä. Häntä syytettiin liian tunteellisuudesta ja manipulatiivisuudesta, ja hänen tekniikansa herättivät kiistaa.
* Hänen näkemyksensä sosiaalisesta uudistuksesta: Finney oli vahva abolitionismin ja raittiuden puolestapuhuja, mikä asetti hänet ristiriitaan joidenkin yhteiskunnan osien kanssa, joilla oli vastakkaisia näkemyksiä.
* Hänen kiistansa presbyteerikirkossa: Finneyn "vapaan tahdon" korostaminen ja hänen epätavalliset näkemyksensä predestinaatiosta aiheuttivat jännitteitä presbyteerikirkossa, mikä johti lopulta hänen irtautumiseen kirkkokunnasta.
* Hänen kamppailunsa mielenterveyden kanssa: Finney koki masennuksen ja ahdistuksen aikoja koko elämänsä ajan, mikä vaikutti toisinaan hänen palvelukseensa.
* Hänen vaikutuksensa nykyaikaiseen evankeliseen maisemaan: Vaikka Finneyn perintö on laaja, jotkut kriitikot väittävät, että hänen henkilökohtaisen kääntymyksensä ja emotionaalisuuden painottaminen vaikutti lopulta yksilöllisemmän ja vähemmän sosiaalisesti sitoutuneen evankelikaalisen muodon nousuun.
On tärkeää muistaa, että nämä ovat tulkintoja historiallisista tapahtumista. Finneyn epäonnistumiset eivät välttämättä olleet henkilökohtaisia puutteita, vaan pikemminkin kiistakohtia aikansa ja vallitsevan uskonnollisen ja sosiaalisen maiseman kontekstissa.
Lopulta Charles G. Finneyn elämä ja palvelus olivat monimutkaisia ja monitahoisia, ja vaikka hän koki haasteita ja kiistoja, hän jätti myös kiistattoman jäljen Amerikan uskonnon historiaan.