Joitakin teemoja, joita Wharton tutki kirjoituksessaan, ovat:
- Sosiaalinen eriarvoisuus: Whartonin työssä tarkasteltiin usein luokkajakoa ja vähemmän onnellisten ahdinkoa. Romaaneissaan The House of Mirth (1905) ja The Custom of the Country (1913) hän kuvasi naisten kamppailuja, jotka ovat jääneet sosiaalisten rooliensa ja taloudellisen riippuvuuden miehistä loukkuun.
- Sukupuoliroolit: Whartonin kirjoitus haastoi usein perinteiset sukupuolinormit. Romaaneissaan Ethan Frome (1911) ja Summer (1917) hän tutki naisten ahdinkoa, joilta evättiin itseilmaisu ja täyttymys miesvaltaisessa yhteiskunnassa.
- Aviorikos ja moraalinen epäselvyys: Whartonin hahmot joutuivat usein avioliiton uskottomuuden ja moraalisten pulmien monimutkaisiin verkkoihin. Romaaneissaan The Age of Innocence (1920) ja The Reef (1912) hän tutki sosiaalisten sopimusten ja henkilökohtaisen moraalin välistä hämärtynyttä rajaa.
- Kulttuuri-identiteetti ja maastamuutto: Whartonin työssä tutkittiin myös Euroopassa asuvien amerikkalaisten kokemuksia. Romaaneissaan Päätöksen laakso (1902) ja The Mother's Recompense (1925) hän kuvasi jännitteitä vanhan ja uuden välillä sekä erilaisten kulttuuri-identiteettien väliin jääneiden kohtaamia haasteita.
Whartonin työ tunnetaan psykologisesta syvyydestään, sosiaalisista kommenteistaan ja elegantista kirjoitustyylistään. Hän oli yksi ensimmäisistä amerikkalaisista kirjailijoista, joka sai kansainvälisen suosion, ja hänen teoksiaan luetaan ja tutkitaan edelleen laajalti.