On kuitenkin tärkeää ymmärtää, että jopa loistavimmilla taiteilijoilla on rajoituksensa ja haasteensa. Jotkut näkökohdat, joita voitaisiin pitää "epäonnistumina" tai heikkouksina Rafaelin työssä, vaikka niistä usein keskustellaan taidehistorioitsijoiden keskuudessa, ovat:
* Rajoitettu keskittyminen tunteisiin ja realismiin: Michelangeloon verrattuna Rafaelin hahmoista puuttuu usein firenzeläisen mestarin työlle ominaista tunnesyvyys ja psykologinen monimutkaisuus. Jotkut kriitikot ehdottavat, että Rafael asetti idealisoidun kauneuden ja harmonian etusijalle tunnerealismin sijaan.
* Avustajien käyttäminen: Raphaelin studio tunnettiin suuresta avustajaryhmästään, ja jotkut kriitikot väittävät, että tämä johti epäjohdonmukaisuuksiin hänen työssään, erityisesti myöhempinä vuosina. Vaikka Rafaelin ohjaus ja ohjaus olivat ilmeisiä, on kiistelty, oliko yleinen taiteellinen visio aina hänen omansa.
* Kiista "muutos": Rafaelin viimeinen maalaus "The Transfiguration" valmistui postuumisti hänen studiossaan. Vaikka sävellys ja konsepti johtuvat Raphaelista, teloituksen uskotaan olleen useissa käsissä. Tämä on johtanut keskusteluun siitä, missä määrin lopputyö heijastaa Rafaelin todellisia aikomuksia.
On tärkeää muistaa, että nämä näkökohdat eivät ole epäonnistumisia taiteellisen epäpätevyyden mielessä. Pikemminkin ne ovat rajoituksia tai alueita, joilla Rafaelin taiteellinen lähestymistapa poikkesi hänen aikalaistensa lähestymistavasta tai joilla hänen aikansa haasteet vaikuttivat hänen työhönsä.
On hedelmällisempää arvostaa Rafaelin voittoja, hänen uskomatonta kykyään vangita kauneutta, armoa ja harmoniaa työssään sekä hänen pysyvää vaikutustaan taidehistoriaan. Hänen perintönsä on poikkeuksellista taitoa, taiteellista loistoa ja kestävää vaikutusta.