Tässä on mitä tiedämme hänen musiikillisesta tuotannostaan:
* Hän oli pääasiassa kirkkomuusikko. Tästä syystä suurin osa hänen sävellyksistään oli tarkoitettu uskonnollisiin tilaisuuksiin, kuten kantaatteihin, motetteihin ja urkuihin.
* Hänen uskotaan kirjoittaneen useita kantaatteja ja koraaleja. Valitettavasti mikään näistä ei ole säilynyt.
* Hän kirjoitti myös muutaman kosketinkappaleen. Jotkut niistä ovat edelleen säilyneet, mukaan lukien "Allein Gott in der Höh sei Ehr" ja "Christ lag in Todesbanden", joita pidetään barokin urkumusiikin varhaisina esimerkkeinä.
On tärkeää muistaa, että tietämyksemme Johann Christoph Bachin teoksista on hyvin rajallista, koska käsikirjoituksia ei ole säilynyt. Siksi on mahdotonta tarjota kattavaa luetteloa hänen sävellyksistään.
Kuitenkin säilyneet teokset tarjoavat arvokkaan näkemyksen musiikilliseen ympäristöön, jossa Johann Sebastian Bach varttui ja sai vaikutteita.