Tekijäkysymys :Yksi Shakespearen kestävimmistä mysteereistä on hänen teostensa tekijä. Vaikka valtaosa tutkijoista pitää näytelmät ja sonetit Shakespearen ansioksi, pieni ryhmä skeptikkoja, jotka tunnetaan "antistratfordilaisina", kyseenalaistaa, oliko hän todellinen kirjoittaja. Vaihtoehtoisia ehdokkaita on ehdotettu, mutta yksimielisyyttä ei ole siitä, keitä he olisivat saaneet olla.
Kadonneet toistot :Shakespearen uskotaan kirjoittaneen noin 38 näytelmää, mutta vain 36 on säilynyt. Kaksi näytelmää, "Cardenio" ja "Love's Labour's Won", mainitaan nykyaikaisissa levyissä, mutta niitä ei ole koskaan löydetty. Tutkijat ovat spekuloineet niiden sisällöstä ja merkityksestä, mutta niiden katoaminen on edelleen ratkaisematon mysteeri.
Piilotetut viestit ja koodit :Kaikkien Shakespearen teosten aikana jotkut lukijat ovat väittäneet löytäneensä piilotettuja viestejä, koodeja ja profetioita. Nämä tulkinnat sisältävät usein monimutkaisia numerologisia kuvioita tai anagrammeja, mutta ne ovat edelleen erittäin kiistanalaisia, eivätkä tutkijat ole hyväksyneet niitä laajasti.
The Dark Lady :Shakespearen soneteissa on viittauksia salaperäiseen "pimeään naiseen", joka on puhujan halun ja kiintymyksen kohde. Tämän naisen henkilöllisyys on ollut spekuloinnin kohteena, ja jotkut ovat ehdottaneet hänen olleen todellinen historiallinen henkilö, kun taas toiset uskovat hänen olevan kirjallinen keksintö.
Tunnistamattomat hahmot :Useissa Shakespearen näytelmissä on hahmoja, jotka esiintyvät lavalla ilman nimeä tai erityistä identiteettiä. Esimerkiksi "Hamletin" kuuluisia haudankaivajia ja "Macbethin" portteria kutsutaan yksinkertaisesti "ensimmäiseksi haudankaivajaksi", "toiseksi haudankaivajaksi" ja "portteriksi". Syyt näiden nimeämättömien hahmojen takana ovat hämmentäneet tutkijoita ja johtaneet erilaisiin tulkintoihin.
Sonettien mysteeri :Shakespearen sonettien julkaisuhistoria herättää kysymyksiä. Ensimmäiset 176 sonettia julkaistiin kvarttopainoksessa vuonna 1609 ilman Shakespearen lupaa, ja loput 28 sonettia ilmestyivät Ensimmäisessä Foliossa vuonna 1623. Tämän erottelun syyt ja sonettien järjestys molemmissa painoksissa ovat edelleen epäselviä.
Shakespearen varhainen elämä :Shakespearen elämästä tiedetään suhteellisen vähän ennen kuin hän aloitti kirjailijauransa Lontoossa. Yksityiskohtia hänen koulutuksestaan, varhaisista vaikutuksistaan ja henkilökohtaisista kokemuksistaan tänä aikana ei ole dokumentoitu hyvin, mikä jättää aukkoja ymmärryksemme hänen kehityksestään kirjailijana.
Nämä ovat vain muutamia esimerkkejä William Shakespearen ympärillä olevista tuntemattomista tosiasioista ja ratkaisemattomista salaisuuksista. Vaikka tutkijat ovat edistyneet merkittävästi hänen elämänsä ja työnsä ymmärtämisessä, on edelleen mysteereitä ja vastaamattomia kysymyksiä, jotka edistävät Shakespearen perinnön jatkuvaa kiehtovuutta.