Muoto: Tallennin on suhteellisen yksinkertainen instrumentti, jossa on suora runko ja pieni suukappale. Huilulla on sen sijaan monimutkaisempi muoto, jossa on kaareva päänivel, runko avaimilla ja reikillä sekä jalkaliitos.
Ääni: Nokkahuilun ääni on tyypillisesti pehmeää ja pehmeää, kun taas huilun ääni on kirkkaampi ja lävistävämpi. Tämä johtuu soittimien erilaisista soittotavoista. Nokkahuilua soitetaan puhaltamalla ilmaa suukappaleeseen, kun taas huilua soitetaan puhaltamalla ilmaa päänivelessä olevan reiän yli.
Alue: Nokkahuilussa on noin kahden oktaavin rajoitettu alue, kun taas huilulla on laajempi, noin kolmen oktaavin alue. Tämä tarkoittaa, että huilu voi soittaa korkeampia ja matalampia säveliä kuin nokkahuilu.
Tekniikka: Nokkahuilu on suhteellisen helppo oppia instrumentti, kun taas huilu on vaikeampaa. Tämä johtuu siitä, että huilu vaatii tarkempaa embouchurea (tapa, jolla pelaajan huulet ja suu ovat asennossa) ja parempaa koordinaatiota sormien ja hengityksen välillä.
Repertuaari: Nokkahuilussa on laaja ohjelmisto musiikkia, joka on kirjoitettu erityisesti instrumentille. Huilulla on myös laaja ohjelmisto, mutta se sisältää myös musiikkia, joka on alun perin kirjoitettu muille soittimille, kuten viululle tai pianolle.
Kaiken kaikkiaan nokkahuilu ja huilu ovat kaksi erilaista instrumenttia, joilla on erilaiset äänet, alueet, tekniikat ja ohjelmistot.