Kalsedoni on kryptokiteisen kvartsin yleisin muoto. Termi "kryptokiteinen" tarkoittaa, että mineraalin muodostavat kiteet ovat niin pieniä, että niitä ei voida tunnistaa paljaalla silmällä eikä normaalilla mikroskoopilla. Kun se on läsnä kryptokiteisenä aggregaattina kuitumuodossa, siitä tulee jalokivi, joka tunnetaan nimellä krysopraasi.
Termiä kalsedoni käytetään kahdessa erityistapauksessa:ensinnäkin tietyntyyppiselle mikrokiteiselle rakenteelle, jolle on tunnusomaista vuorottelevat kryptokiteisen kvartsin kuitukerrokset; toiseksi laajemmin kuvaamaan erilaisia jalokiviä, jotka sopivat tähän kuvaukseen, mukaan lukien läpikuultavat lajikkeet, kuten akaatti, karneoli, krysopraasi, jaspis ja onyx, sekä joitain läpinäkymättömiä näytteitä.