Voimakkaasta vaikutuksestaan huolimatta Blue-Eyes Shining Dragonilla on joitain heikkouksia, jotka on syytä huomioida:
Tribute Summoning: Blue-Eyes Shining Dragon vaatii kaksi Tributes to Summon -kutsua, mikä voi olla huomattavia kustannuksia, varsinkin jos sinulla ei ole tarvittavia hirviöitä kentällä.
Poistotehosteet: Blue-Eyes Shining Dragon on alttiina poistotehosteille, kuten korteista, kuten "Dark Hole" tai "Raigeki". Jos et pysty suojaamaan sitä näiltä vaikutuksilta, saatat menettää lohikäärmeesi ennen kuin voit käyttää sen vaikutuksia.
Negatioefektit: Blue-Eyes Shining Dragonin tehosteet voidaan mitätöidä korteilla, kuten "Solemn Judgment" tai "Effect Veiler". Jos vastustajasi voi mitätöidä sen vaikutukset, menetät sen tarjoamat voimakkaat edut.
Tietyt laskurit: Jotkut kortit on erityisesti suunniteltu torjumaan Blue-Eyes Shining Dragon. Esimerkiksi "Galaxy Cyclone" voi karkottaa Blue-Eyes Shining Dragonin kentältä, ja "Red-Eyes Darkness Metal Dragon" voi mitätöidä sen vaikutukset ja tuhota sen taistelussa.
Rajoitettu tuki: Vaikka Blue-Eyes Shining Dragon on itsessään tehokas kortti, sillä ei ole niin paljon tukea kuin joillakin muilla lohikäärmehirviöillä. Tämä tarkoittaa, että sinulla voi olla vaikeuksia rakentaa kantta, joka pystyy jatkuvasti kutsumaan ja suojelemaan sitä.
Ymmärtämällä Blue-Eyes Shining Dragonin heikkoudet voit paremmin valmistautua vastustamaan sitä taistelussa ja minimoimaan sen vaikutuksen peliisi.