Rotujen ja kulttuurien edustus :Haiden ja suihkukoneiden esittäminen puertoricolaisten ja muiden maahanmuuttajaryhmien pohjalta joutui aluksi kritiikkiin mahdollisten stereotypioiden vuoksi. Varhaiset arvioijat pitivät joitakin näkökohtia loukkaavina, mikä aiheutti syytöksiä kulttuurisesta tunteettomuudesta. Musikaaliin on kuitenkin tehty muutoksia ajan mittaan näiden huolenaiheiden ratkaisemiseksi.
Jängiväkivalta ja sosiaalinen puute :West Side Story kuvaa elävästi kaupunkien köyhyyden, jengikulttuurin ja väkivallan ankaraa todellisuutta 1900-luvun puolivälissä. Jotkut kriitikot väittävät, että jengiväkivallan ja sosiaalisen puutteen esittäminen saattaa olla liian intensiivistä ja sopimatonta nuoremmille yleisöille.
Traaginen loppu :Päähenkilöiden Tonyn ja Marian traagista kohtaloa on pidetty kiistanalaisena. Jotkut yleisöt pitivät loppua liian pessimistisenä ja kritisoivat positiivisemman ratkaisun puuttumista tai toivoa sovinnosta sotivien ryhmittymien välillä.
Sukupuolen edustus :Naisten roolit ja edustus alkuperäisessä tuotannossa ovat herättäneet kritiikkiä perinteisten sukupuolistereotypioiden vahvistamisesta ja naishahmojen esittämisestä miehistä riippuvaisina. Nykyaikaiset sovitukset ja tuotannot ovat pyrkineet käsittelemään tätä sukupuolidynamiikkaa ja tarjoamaan naishahmojen vivahteikkaampia kuvauksia.
On syytä huomata, että näitä kiistoja on käsitelty vuosien varrella, ja musikaaliin on tehty erilaisia muutoksia ja tarkistuksia, jotta se olisi kattavampi, edustavampi ja herkkä näille huolenaiheille.