* Izanagi: Vaikka Madara oli kriittisesti haavoittuneita, hän aktivoi Izanagin, kielletyn jutsun, jonka avulla käyttäjä voi kirjoittaa todellisuuden uudelleen, tekemällä lähinnä mistä tahansa tapahtumasta "unelma" tai illuusion. Izanagi -käyttämällä Madara pakeni kuolemasta.
* Rinnen uudestisyntyminen: Madaralla oli salainen suunnitelma paikallaan. Hän oli manipuloinut Rogue Shinobin ryhmää Akatsukia kerätäkseen yhdeksän takaosaa, voimakasta olentoa, jotka pitävät valtavaa chakraa. Kun heidät kerättiin, hän aikoi käyttää Rinnen uudestisyntymistä, kiellettyä jutsua, jonka avulla käyttäjä voi tuoda ihmiset takaisin elämään.
* Gedo -patsas: Hänellä oli myös piilotettu suunnitelma, johon osallistui gedon patsas, massiivinen patsas, joka absorboi hännän pedon chakraa. Tämä patsas oli avain hänen herätykseen, koska se sijoittui Rinne Sharinganiin.
* Musta Zetsu: Hänellä oli salaperäinen kumppani, Black Zetsu, joka syntyi Chakran esijännitekniikan Kaguya Otsutsukin tahdosta. Black Zetsulla oli avainasemassa Madaran manipuloinnissa ja hänen ylösnousemuksensa järjestämisessä.
Lyhyesti sanottuna Madaran "ylösnousemus" oli monikerroksinen järjestelmä, johon osallistui:
1. Izanagin käyttäminen paeta kuolemaa Hashiraman kanssa käydyn taistelun aikana.
2. Akatsukin manipulointi pyrstöhetojen keräämiseksi Rinnen uudestisyntymiseksi.
3. Gedo -patsaan käyttäminen Rinne Sharinganin taloon.
4. Musta Zetsun vaikutusvallan ja strategisen suunnittelun hyödyntäminen.
On tärkeää huomata, että vaikka Madara elvysi itsensä onnistuneesti, hän ei ollut todella elossa. Hän oli sielu, joka asutti gedon patsaa, jossa vartalo, jota ohjaavat hännän pedot.