Hänen kuolemansa johtui ampumaportaan teloituksesta bolshevikkihallituksen määräyksestä. Virallisena kuolinsyynä mainittiin "teloitus ampumajoukolla", vaikkakin on olemassa ristiriitaisia näkemyksiä ja teorioita erityisistä olosuhteista. Jotkut kertomukset viittaavat siihen, että perhe ammuttiin lähietäisyydeltä, kun taas toiset väittävät, että heidät ammuttiin alun perin ja lopetettiin sitten pistimellä.
On tärkeää huomata, että Romanovin perheen teloituksen olosuhteista kiistellään ja kiistetään edelleen. Jotkut historioitsijat väittävät, että teloitus oli välttämätön teko vastavallankumouksen estämiseksi, kun taas toiset näkevät sen julmana ja perusteettomana murhana. Tulkinnasta riippumatta tsaarin ja hänen perheensä teloitus on edelleen merkittävä historiallinen tapahtuma, jota tutkitaan ja keskustellaan edelleen.