Tehostajat:Nämä ovat DNA-sekvenssejä, jotka sitovat transkriptiotekijöitä ja edistävät lähellä olevien geenien transkriptiota. Esimerkiksi tehostaja immunoglobuliinin raskaan ketjun lokuksessa on vastuussa näiden geenien korkeasta ekspression tasosta B-soluissa.
Promoottorit:Nämä ovat DNA-sekvenssejä, jotka sitovat RNA-polymeraasia ja käynnistävät geenien transkription. Esimerkiksi ihmisen kasvuhormonigeenin promoottori on vastuussa tämän geenin ilmentymisestä aivolisäkkeessä.
Äänenvaimentimet:Nämä ovat DNA-sekvenssejä, jotka sitovat transkriptiotekijöitä ja tukahduttavat lähellä olevien geenien transkription. Esimerkiksi ihmisen β-globiinigeenin äänenvaimennin on vastuussa tämän geenin tukahduttamisesta ei-erytroidisoluissa.
Transaktiojaksot:
Transkriptiotekijät:Nämä ovat proteiineja, jotka sitoutuvat cis-toimiviin sekvensseihin ja säätelevät geenien transkriptiota. Esimerkiksi transkriptiotekijä Oct-1 sitoutuu oktameerimotiiviin immunoglobuliinin raskaan ketjun tehostajassa ja edistää näiden geenien transkriptiota B-soluissa.
RNA-polymeraasi:Tämä on proteiinikompleksi, joka sitoutuu promoottoriin ja transkriptoi geenejä RNA:ksi.
Muut säätelyproteiinit:Nämä ovat proteiineja, jotka sitoutuvat cis-toimiviin sekvensseihin ja säätelevät geenien transkriptiota eri tavoin. Esimerkiksi CTCF-proteiini sitoutuu ihmisen β-globiinigeenin CCCTC-motiiviin ja auttaa järjestämään tämän alueen kromatiinirakennetta, mikä on välttämätöntä geenin repressoimiseksi ei-erytroidisoluissa.