2. Etsi salainen tukikohta. Sinnohissa on monia erilaisia salaisia tukikohtia. Jotkut suosituimmista paikoista ovat:
* Pieni saari reitillä 218
* Luola lähellä kadonneen tornin sisäänkäyntiä reitillä 213
* Rakenteilla oleva talo Pastoria Cityssä
3. Käytä Secret Base Kitiä. Kun olet löytänyt salaisen tukikohdan, luo tukikohta Secret Base Kitin avulla. Voit valita pohjan tyypin, jonka haluat luoda, ja voit myös koristella sen huonekaluilla ja muilla esineillä.
4. Rekrytoi tiimin jäseniä. Voit värvätä muita pelaajia liittymään salaiseen perustiimiisi. Voit tehdä tämän keskustelemalla rekrytoitavan henkilön kanssa ja valitsemalla "Rekrytoi" -vaihtoehdon.
5. Taistele muita joukkueita vastaan. Voit taistella muiden joukkueiden salaisia tukikohtia vastaan puhumalla tukikohdan sisäänkäynnissä olevalle henkilölle ja valitsemalla "Taistelu"-vaihtoehdon. Salaiset perustaistelut ovat 2-2-taisteluja, ja voittaja on ensimmäinen joukkue, joka tyrmää molempien vastustajiensa Pokemonit.
6. Ansaitse pisteitä ja palkintoja. Voit ansaita pisteitä voittamalla salaisia tukikohtataisteluja ja suorittamalla salaisia tukitehtäviä. Voit käyttää pisteitä ostaaksesi kohteita Secret Base Shopista, ja voit käyttää niitä myös salaisen tukikohdan päivittämiseen.