Whitmanin verilöyly oli monimutkainen ja traaginen tapahtuma. Jotkut kertomukset viittaavat siihen, että Whitmanit tapettiin kostoksi tuhkarokkoepidemialle, joka oli pyyhkäissyt läpi Cayuse-heimon ja jonka monet uskoivat lähetyssaarnaajien levittämän tarkoituksella. Toiset väittävät, että verilöyly johtui Cayusen kaunasta heidän alueelleen saapuvien uudisasukkaiden kasvavasta määrästä.
Oli syy mikä tahansa, verilöyly merkitsi käännekohtaa Amerikan lännen historiassa, ja se on edelleen kiistanalainen ja tunteellinen aihe tähän päivään asti.