Tässä on joitain tärkeimpiä eroja Naruton ja Yu-gi-ohin välillä:
* Tyylilaji: Naruto on shonen-toimintaanime, kun taas Yu-gi-oh on shonen-korttipelianime.
* Asetus: Naruto sijoittuu ninjakylien maailmaan, kun taas Yu-gi-oh sijoittuu maailmaan, jossa ihmiset voivat taistella keskenään korteilla.
* Hahmot: Naruto seuraa Naruto Uzumakin, nuoren ninjan, seikkailuja, joka unelmoi tulla Hokageksi, kylänsä johtajaksi. Yu-gi-oh seuraa Yugi Mutoun, nuoren pojan seikkailuja, jolla on Millennium Puzzle, voimakas artefakti, jonka avulla hän taistelee muita kaksintaistelijoita vastaan.
* Pelattavuus: Narutossa on nopeatempoisia ninjataisteluja, joissa hahmot käyttävät chakraaan suorittaakseen erilaisia jutsuja (tekniikoita). Yu-gi-oh sisältää strategisen korttipelin, jossa pelaajat käyttävät korttejaan hirviöiden kutsumiseen, loitsuihin ja ansojen asettamiseen.
Viime kädessä paras tapa päättää, mikä animesarja sopii sinulle paremmin, on katsoa jokaisesta muutama jakso ja nähdä, kummasta pidät enemmän.