Sabrinan kuntosali sijaitsee Saffron Cityssä, mutta sinne ei pääse Yellowissa. Koko Saffron City ei ole tavoitettavissa keltaisella värillä, koska se on pelin pääympäristönä toimivan Silph Co:n sijainti.
Yellow Versionissa sinun on keskityttävä Kanton Pokémonien vangitsemiseen ja osallistumiseen Silph Co:ssa tapahtuviin tapahtumiin. Koko tarina pyörii kuuluisan Pokémon-tutkijan sieppauksen ympärillä, ja sinun on pelastettava hänet ja selvitettävä ilkeä Rakettiryhmä.
Keltaisessa versiossa Saffron Cityssä ei kuitenkaan ole kuntosalia, joten et voi taistella Sabrinaa vastaan.